Ib txoj kev tshawb fawb tsis ntev los no tau luam tawm hauvMicrobiometau ua qhov kev tshuaj xyuas metagenomic ntawm cov kab mob ntawm 846 tus tsiaj qus me me—xws li cov nas tsuag, cov nas tsuag, thiab cov nas tsuag—uas tau sau los ntawm Sierra Leone, West Africa. Kev tshawb fawb tau txheeb xyuas tag nrho 39 tus kab mob RNA cuam tshuam nrog cov tsiaj txhu, suav nrog 26 tus kab mob tshiab thiab 13 tus kab mob uas tau paub yav dhau los. Ntawm cov no, tsev neeg Paramyxoviridae tau pom tias muaj ntau haiv neeg sib txawv, thaum cov nas tsuag muaj ntau hom kab mob ntau tshaj plaws (n = 26).
Kev ntsuam xyuas kev pheej hmoo ntawm tsiaj txhu tau qhia txog peb tus kab mob zoonotic uas paub lawm—tus kab mob encephalomyocarditis, tus kab mob Lassa, thiab Rocahepevirus sp.—nrog rau peb tus kab mob uas muaj feem yuav kis tau: tus kab mob Melian, tus kab mob siab rau nas, thiab Hunnivirus A. Qhov tseem ceeb, ntawm cov kab mob tshiab uas tau txheeb xyuas, Bat ledantevirus 2 tau qhia txog kev sib raug zoo ze tshaj plaws rau tus kab mob Le Dantec uas kis rau tib neeg. Kev tshuaj xyuas serological ntxiv tau pom cov tshuaj tiv thaiv kab mob tiv thaiv tus kab mob no hauv 2.8% ntawm cov neeg nyob hauv zos, qhia tias yav dhau los, tej zaum tsis tau pom, tau kis rau tib neeg.
Cov kev tshawb pom no qhia txog qhov muaj cov kab mob loj heev uas cov nas tswj hwm hauv West Africa thiab qhia txog qhov tseem ceeb ntawm cov tswv yim saib xyuas kev sib koom ua ke ntawm tib neeg-tsiaj. Kev sib xyaw ua ke ntawm kev tshuaj ntsuam metagenomic nrog kev lees paub serological muab lub moj khaum ruaj khov rau kev txheeb xyuas cov kab mob uas muaj peev xwm kis tau los ntawm tsiaj thiab tsiaj txhu.
Tau kaum xyoo dhau los no, ntau dua 60% ntawm cov kab mob sib kis tshiab hauv tib neeg tau pib los ntawm cov tsiaj txhu, nrog rau cov nas tsuag, cov nas tsuag, thiab cov nas me uas tau lees paub tias yog cov chaw tseem ceeb ntawm cov kab mob zoonotic. Tebchaws Africa tau suav tias yog qhov chaw kub rau cov kab mob zoonotic. Piv txwv li, Sierra Leone tau tshaj tawm ntau dua 28,000 tus neeg mob thaum xyoo 2014-2016 Ebola sib kis.
Txawm hais tias muaj kev sib kis kab mob zoonotic ntau heev hauv thaj chaw no, qhov sib txawv thiab kev faib tawm ntawm cov kab mob hauv cov tsiaj qus me me tseem tsis tau piav qhia txaus. Txhawm rau daws qhov sib txawv no, cov kws tshawb fawb tau ua qhov kev tshuaj xyuas virome ntawm 846 cov tsiaj qus me me uas ntes tau thoob plaws peb qhov chaw hauv Sierra Leone ntawm xyoo 2018 thiab 2023. Txoj kev tshawb fawb no tsom mus rau kev piav qhia txog ntau haiv neeg ntawm cov kab mob, txheeb xyuas cov neeg sib tw uas muaj peev xwm kis tau ntau hom tsiaj, ntsuas qhov kev pheej hmoo ntawm zoonotic, thiab tsim cov pov thawj los txhawb cov txheej txheem ceeb toom ntxov rau cov kab mob sib kis tshiab.
Cov Txheej Txheem Tseem Ceeb
Txoj kev tshawb fawb no tau siv cov txheej txheem ua haujlwm ntawm viral metagenomics:
- Kev ua qauv:Cov nqaij ntawm lub plawv, siab, po, ntsws, thiab raum tau raug sau, sib sau ua ke, sib xyaw, thiab raug rho tawm tag nrho RNA.
- Kev txheeb xyuas thiab sib dhos:Ua ntej tsim lub tsev qiv ntawv, kev tshem tawm ribosomal RNA tau ua tiav, tom qab ntawd los ntawm kev siv high-throughput sequencing siv Illumina NovaSeq 6000 platform. Cov kab mob sib xyaw tau sib sau ua ke de novo.
- Kev txheeb xyuas tus kab mob:Cov kab mob tau txheeb xyuas raws li RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) gene alignment. Tsuas yog cov kab mob vertebrate-associated viruses xwb thiaj li khaws cia, tsis suav nrog cov kab mob bacterial, fungal, thiab cov kab mob nroj tsuag.
- Kev tshuaj xyuas bioinformatics:Kev tsim kho dua tshiab ntawm phylogenetic, kev tshuaj xyuas kev sib koom ua ke, kev ua qauv sib kis ntawm ntau hom tsiaj, thiab kev ntsuam xyuas kev pheej hmoo ntawm zoonotic tau ua tiav.
- Kev kuaj xyuas serological:Ib qho kev sim ua kom tsis muaj zog ntawm tus kab mob VSV tau tsim rau tus kab mob Bat ledantevirus 2. Cov tshuaj tiv thaiv kab mob tau pom muaj nyob rau hauv 2.8% ntawm cov ntshav tib neeg, qhia txog kev sib kis ntawm cov tsiaj mus rau lwm tus.
KawmCov txiaj ntsig
1. Kev Tshawb Pom Kab Mob thiab Kev Sib Txawv
Txoj kev tshawb fawb no tau ua qhov kev tshuaj xyuas transcriptomic sequencing ntawm 846 tus tsiaj qus uas tau sau los ntawm Sierra Leone, suav nrog cov nas, cov nas tsuag, thiab cov shrews. Raws li cov RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) gene sequences tiav, tag nrho muaj 39 tus kab mob RNA cuam tshuam nrog tsiaj txhu tau txheeb xyuas, suav nrog 13 tus kab mob uas tau paub yav dhau los thiab 26 tus kab mob tshiab.
Hais txog cov kab mob sib xyaw ua ke, tsev neeg Paramyxoviridae tau pom tias muaj ntau haiv neeg sib txawv ntau tshaj plaws thoob plaws peb pawg neeg tswj hwm, ua raws li Astroviridae thiab Picornaviridae. Hais txog kev faib tawm ntawm tus tswv tsev, cov nas tau pab txhawb nqa ntau haiv neeg sib txawv ntawm cov kab mob, muaj tag nrho 26 hom kab mob, qhia txog lawv lub luag haujlwm tseem ceeb ua cov chaw khaws cia ntau haiv neeg sib txawv ntawm cov kab mob hauv thaj av.
2. Kev Pheej Hmoo ntawm Cov Kab Mob Sib Kis
Kev ntsuam xyuas kev pheej hmoo ntawm tsiaj txhu tau txheeb xyuas peb hom kab mob zoonotic: tus kab mob encephalomyocarditis, tus kab mob Lassa, thiab hom kab mob Rocahepevirus. Tsis tas li ntawd, peb hom kab mob—Melian virus, tus kab mob siab rau nas, thiab Hunnivirus A—tau raug txheeb xyuas tias muaj kev pheej hmoo kis mus rau lwm qhov.
Ntawm 26 tus kab mob tshiab uas tau tshawb pom, plaub tus tau kwv yees tias muaj peev xwm kis tau zoonotic ntau raws li cov yam ntxwv phylogenetic thiab genomic. Qhov tseem ceeb, Bat ledantevirus 2 tau qhia txog kev sib raug zoo tshaj plaws rau tus kab mob Le Dantec uas kis rau tib neeg.
Kev tshawb nrhiav txog kab mob tom qab ntawd tau txhawb nqa qhov kev tshawb pom no, vim tias cov tshuaj tiv thaiv kab mob Bat ledantevirus 2 tau pom muaj nyob rau hauv 2.8% ntawm cov kab mob hauv zos. Qhov tshwm sim no qhia tau hais tias cov kab mob uas tsis paub lossis tsis muaj tsos mob tej zaum yuav tau tshwm sim hauv cov pej xeem, qhia txog txoj kev sib kis kab mob zoonotic uas muaj peev xwm tab sis yav dhau los tsis tau pom.
3. Kev Sib Kis ntawm Cov Hom Kab Mob Sib Txawv
Kev tshuaj xyuas kev sib kis ntawm ntau hom tsiaj tau qhia tias cov nas nyob hauv qhov chaw tseem ceeb hauv lub network sib koom cov kab mob, ua haujlwm ua cov nodes tseem ceeb uas pab txhawb kev sib pauv kab mob ntawm cov tsiaj txhu. Tag nrho muaj 15 tus kab mob tau txheeb xyuas tias muaj peev xwm kis tau ntau hom tsiaj.
Kev tshuaj xyuas ntxiv txog cov qauv kev sib kis kab mob hla kev txiav txim qhia tau hais tias kev sib koom ua ke ntawm cov kab mob tau tshwm sim ntau dua ntawm cov tswv tsev hauv tib qho kev txiav txim, qhia tias kev sib raug zoo ntawm tus tswv tsev ua lub luag haujlwm tseem ceeb hauv kev sib kis kab mob. Qhov sib txawv, cov nas tsuag tau pom tias muaj peev xwm qis dua rau kev sib kis kab mob hla kev txiav txim.
Qhov tseem ceeb, muaj pov thawj ntawm kev nthuav dav ntawm tus tswv tsev tau pom hauv qee cov kab mob. Piv txwv li, tus kab mob Melian, uas yav dhau los tau suav tias yog tshwj xeeb rau cov shrews, kuj tau pom hauv cov nas hauv kev tshawb fawb no, qhia txog kev hloov pauv ntawm tus tswv tsev hloov pauv thiab kev pheej hmoo ntawm kev sib kis dav dua.
Cov Lus Xaus thiab Kev Cuam Tshuam rau Kev Noj Qab Haus Huv Pej Xeem
- Muaj ntau hom kab mob sib txawv hauv cov tsiaj qus me me:Qhov kev tshawb pom ntawm 39 tus kab mob RNA, suav nrog 26 hom kab mob tshiab, qhia txog lub chaw khaws cia kab mob loj hauv thaj av thiab tshaj tawm thawj zaug tias muaj cov kab mob tshiab uas muaj peev xwm kis tau zoonotic siab (piv txwv li, Bat ledantevirus 2).
- Cov nas ua lub hom phiaj tseem ceeb rau kev saib xyuas:Cov nas ua lub hauv paus tseem ceeb rau kev sib kis kab mob thiab muaj ntau hom kab mob sib txawv siab tshaj plaws, uas sawv cev rau qhov muaj kev pheej hmoo loj tshaj plaws.
- Xav tau cov tswv yim saib xyuas kev sib koom ua ke:Cov kev tshawb pom txhawb nqa qhov tseem ceeb rau cov nas hauv cov kev pab cuam saib xyuas nquag thiab siv cov txheej txheem sib koom ua ke ua ke metagenomics, serology, thiab kev saib xyuas ecological ntawm tib neeg-cov tsiaj qus sib cuam tshuam.
Zuag qhia tag nrho, txoj kev tshawb fawb no muab cov pov thawj tseem ceeb los txhawb cov txheej txheem ceeb toom thaum ntxov thiab cov txheej txheem kev ntsuam xyuas kev pheej hmoo rau cov kab mob zoonotic tshiab, txhawb nqa qhov tseem ceeb ntawm kev saib xyuas ua ntej hauv cov cheeb tsam muaj kev pheej hmoo siab.
Cov Ntaub Ntawv Khoom
Lub sijhawm tshaj tawm: Lub Peb Hlis-23-2026